現階段，農藥殘留檢測儀的使用已經相當廣泛，成為蔬菜水果茶葉農藥殘留檢測的“主力軍”。下面來介紹一下實驗室進行農藥殘留檢測的基本流程。
檢測依據：《蔬菜中有機磷和氨基甲酸酯類農藥殘留量快速檢測》（GB/T5009.199-2003）
試劑組成及保存：
1、緩沖液：取緩沖溶液試劑1袋倒入試劑瓶中，加蒸餾水（或純凈水）至500mL刻度線，溶解攪拌均勻
2、顯色劑：向標有“顯色劑”的試劑瓶中加入12.5mL的緩沖溶液，溶解，混勻即可。
3、底物：向標有“底物”的試劑瓶中加入12.5mL蒸餾水，溶解、混勻即可，50微升/次。4、酶試劑：敲開玻璃試劑瓶將酶液倒入備用的白色空瓶內，直接使用。
樣品制備流程：
1、擦去果蔬樣品表面泥土，稱取1g果蔬樣品（葉菜剪成寬度1厘米左右的菜樣，塊根菜取橫截面樣品）放入燒杯或提取瓶中，加入5mL緩沖溶液，振搖2分鐘。
2、若浸提液澄清無色或顏色較淺，可直接作為待測樣液；若浸提液渾濁，則需要過濾，濾液作為待測樣液。
3、若浸提液色素干擾，可對樣品進行整株提取。
4、擦去果蔬樣品表面泥土，稱取1g果蔬樣品（葉菜剪成寬度1厘米左右的菜樣，塊根菜取橫截面樣品）放入燒杯或提取瓶中，加入5mL緩沖溶液，振搖，靜置2分鐘。將提取液全部倒入另一支10ml離心管，加入2滴試劑A，搖勻沸水浴5min后，取出冷卻，迷你離心機（6000轉/min）離心2min，取2.5ml澄清液，按照樣品測定進行檢測。
樣品測定過程：
對照液測試：對照液測試：取緩沖液2.5mL，酶試劑50微升，顯色劑50微升至5ml離心管中，室溫放置10分鐘或37℃水浴5min，然后加入50微升底物，搖勻后立即轉移到比色皿中，及時放入儀器比色池第一通道中。（每次開機，對照溶液檢測只需進行一次即可，且必須放入1通道。）
樣品溶液測試：取待測樣品液2.5mL，酶試劑50微升，顯色劑50微升至5ml離心管中，室溫放置10分鐘或37℃水浴5min，然后加入50微升底物，搖勻后立即轉移到比色皿中，及時放入儀器比色池中
結果判定標準：
根據GB/T5009.199-2003要求，抑制率大于50%時檢測結果為陽性，小于50%為陰性，對于陽性樣品要有2次以上重復檢測。